Regionala förbund
Svenska Båtunionen består av 24 regionala Båtförbund. Båtförbunden omfattar ofta länet där det är aktivt eller på annat sätt logiska områden (t ex Mälarens BF omfattar Mälaren medan Saltsjön-Mälarens BF omfattar Stockholm med närområde). Båtförbundet organiserar Båtklubbarna inom "sin" region.
Båtförbundet skall samordna det regionala båtlivet, fungera som remissinstans för länsstyrelse mm och vara medlemsklubbarnas kontakt om de behöver externt stöd i sin verksamhet. Organisationen ser ofta ut som riksorganisationen, dvs man har en styrelse och ämneskommittéer eller enskilda sakkunniga som arbetar med förvaltning och olika projekt.
Blekinge Båtförbund
Bottenvikens Båtförbund
Dalarnas Båtförbund
Gotlands Seglarförbund
Gästriklands Båtförbund
Hjälmarens Båtförbund
Hälsinglands Båtförbund
Kungliga Motorbåt Klubben
Lidingö BåtförbundMälarens Båtförbund
Navigationssällskapet - Navis
Roslagens Båtförbund
Saltsjön-Mälarens Båtförbund
Skånes Båtförbund
Smålands Båtförbund
Sommens Sjöråd
Sörmlandskustens Båtförbund
Vänern Väst Dalslands Kanals BFVärmlands BF
Värmlands Bergslags Bf
Västerbottens Båtförbund
Västernorrlands Båtförbund
Västkustens Båtförbund
Z-Båtförbund
Östergötlands Båtförbund
Östra Vänerns Båtförbund